Αρχικά η Παιδιατρική Κλινική του Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης ήταν η μοναδική Παιδιατρική Κλινική μέχρι το 1974, οπότε και ιδρύθηκε η Έκτακτη Αυτοτελής Έδρα Παιδιατρικής υπό την διεύθυνση της Καθηγήτριας Σεμίραμις Σκλαβούνου- Τσουρουκτσόγλου, που συστεγάζονταν με την Τακτική Εδρα Παιδιατρικής στην ίδια πτέρυγα του Νοσοκομείου «ΑΧΕΠΑ». Το 1977 η Τακτική Εδρα Παιδιατρικής μεταφέρθηκε στο Νοσοκομείο «Αγία Σοφία», το οποίο το 1988 συνενώθηκε με το «Ιπποκράτειο» Νοσοκομείο με την επωνυμία «Ιπποκράτειο Γενικό Νοσοκομείο» Θεσσαλονίκης και στη συνέχεια, το 1991, εγκαταστάθηκε μαζί με τα εργαστήρια και ειδικά τμήματά της στο κτίριο Δ ́ του Ιπποκρατείου, το οποίο ονομάσθηκε το 2001 κτίριο «Χρίστος Κασίμος».
Το 1986 με διϋπουργική απόφαση του Υπουργείου Υγείας και Πρόνοιας και του Υπουργείου Εθνικής Παιδείας και Θρησκευμάτων, συστήθηκαν 4 Παιδιατρικές και 2 Νεογνολογικές Κλινικές στον Τομέα Υγείας του Παιδιού του Α.Π.Θ. Οι προϋπάρχουσες, Τακτική Εδρα Παιδιατρικής μετονομάσθηκε σε Α ́ Παιδιατρική και η ́Εκτακτη Αυτοτελής σε Β ́ Παιδιατρική Κλινική του Α.Π.Θ., ενώ ιδρύθηκαν οι Γ ́και Δ ́ Παιδιατρικές Κλινικές που εγκαταστάθηκαν στο «ΑΓΙΑ ΣΟΦΙΑ» και «ΑΧΕΠΑ» αντίστοιχα.